Ce billet très court, pour faire l’annonce (un peu tardive) du début d’un MOOC. Ce dernier s’annonce excellent, traitant du séquençage de génomes complets bactériens.

Ce cours estival est proposé par l’excellente Université Technique du Danemark (DTU)

En voici le plan :

WEEK 1
Module 1
Welcome and introduction to typing of bacteria and use of Whole genome sequencing applied to surveillance of bacterial pathogens and antimicrobial resistance
3 vidéos

WEEK 2
Module 2
Introduction to Next Generation sequencing
3 vidéos

WEEK 3
Module 3
Whole genome sequencing tools- demonstration of analysis tools for species identification, MLST typing and finding resistance genes
3 vidéos

WEEK 4
Module 4
Whole genome sequencing tools- demonstration of analysis tools for Serotyping of Salmonella and Escherichia coli strains , and finding plasmid replicons
3 vidéos

WEEK 5
Module 5
Whole genome sequencing tools- demonstration of analysis tools for multiple analyzes, phylogenetic tree building and finding genetic markers from self-made databases and Summative Tutorial exercise
5 vidéos, 1 lecture
Noté: Tutorial final Quiz